Государственное бюджетное учреждение Республики Саха (Якутия) «Агентство субсидий» создано распоряжением Президента РС(Я) от 8 декабря 2010 года №471-р «О создании государственного бюджетного учреждения Республики Саха (Якутия) «Агентство субсидий» в целях унификации и централизации процессов предоставления адресных субсидий населению, начисления сбора платежей населения за жилищно-коммунальные услуги, а также в целях аккумуляции финансовых средств на уровне государственного бюджета РС(Я) для досрочного завоза топливно-энергетических ресурсов.
Распоряжением Президента Республики Саха (Якутия) от 20 мая 2011 года №315-П «Об изменении типа государственного бюджетного учреждения Республики Саха (Якутия) «Агентство субсидий» на государственное казенное учреждение Республики Саха (Якутия) «Агентство субсидий» изменен тип учреждения.
Агентство является подведомственным учреждением Министерства жилищно-коммунального хозяйства и энергетики Республики Саха (Якутия) и осуществляет следующие виды деятельности:
1.Субсидирование ресурсоснабжающих предприятий и поставщиков коммунальных услуг в целях возмещения недополученных доходов, возникающих в связи с государственным регулированием тарифов на коммунальные услуги, с осуществлением контрольных функций за объемом выполняемых работ, определением экономии финансовых средств и ее финансированием;
2.Адресное субсидирование граждан в части оплаты жилищно-коммунальных услуг и проведение единой финансовой политики во всех муниципальных образованиях республики.
3.Создание единой интегрированной информационно-аналитической системы по начислению и сбору платежей населения за жилищно-коммунальные услуги.